教师资格证认定申请表 没有明确的时间规定必须放入档案中，但建议尽快归档，以免造成丢失，影响后续使用。具体归档时间可以参考以下建议：

在校生：

可以将《教师资格认定申请表》交给学校档案馆装入本人档案内，具体流程可以询问学校或者辅导员。

毕业生：

需要找到人事档案存放地，人事档案一般会存放在公司、学校、当地人才市场、生源地人力资源和社会保障局等地方，可以结合自己的情况进行查找。认定成功后，申请人需按“教师资格认定网”的通知时间自行到认定办公室领取证书等材料，并将《认定申请表》复印一份自己留存，原件交给相关部门存入毕业生人事档案。

保存期限：

虽然认定表应该至少保存5-10年，但没有明确规定必须在三年内进行合档。

综上所述，建议尽快将教师资格证认定申请表归档，以确保其安全且易于后续查阅。具体归档时间可以根据个人情况（如是否在校生或毕业生）和当地规定来确定。