根据我国相关法律规定，新疆地区公安机关扣押手机后的归还时间需根据具体情况判断，主要分为以下两种情形：

一、与案件无关的财物扣押

一般情况

若手机经查与案件无关，公安机关应在 3日内解除扣押并退还给原主。

特殊情形

- 若原主不明确的，公安机关应通过公告方式告知原主认领，自通知或公告后 6个月内无人认领的，按无主财物处理。

二、与案件有关的财物扣押

若手机涉及案件调查，需待案件终结后统一处理， 不会立即归还。涉案财物可能用于证据保存或拍卖，具体归还时间取决于案件进展。

法律依据

《刑事诉讼法》第一百四十一条：

对查封、扣押的财物，经查与案件无关的，应在3日内解除查封、扣押，退还原主。

《公安机关办理刑事案件程序规定》第二百三十三条：与案件无关的财物，同样适用3日解除扣押的规定。

注意事项

扣押期间公安机关需妥善保管财物，不得使用、调换或损毁。

若对扣押物品有异议，建议及时联系公安机关核实处理进度。

以上信息综合了《刑事诉讼法》及公安机关办案规范，确保法律适用的一致性。