将“他们是好朋友”改为特殊疑问句，可以有两种表达方式：

针对关系提问

使用疑问词 what引导，询问他们之间的具体关系：

*What is the relationship between them？*

针对主语提问

使用疑问词 who引导，询问具体是哪些人：

*Who are their good friends？*

补充说明

若使用 what，回答通常为：

*They are good friends.*

若使用 who，回答需明确指出人名或身份：

*Tom and Jerry are their good friends.*

选择哪种表达取决于具体语境和需要强调的信息点。