《新还珠格格》中，紫薇的身世真相最终大白是在 第97集。以下是相关情节的梳理：

真相揭露

在第97集中，紫薇向令妃磕头致谢多年照顾，并与尔康以疤痕为线索展开追忆与告白。此时，乾隆皇帝（即皇上）终于确认紫薇是他的亲生女儿，而夏雨荷因皇后陷害含冤去世。

结局片段

该集还包含小燕子被误会、尔康寻找真相、以及最终劫囚等关键情节，但核心转折是皇上的身份揭示。

综上，紫薇与皇上的父女相认及身世谜团解开的标志性场景发生在第97集。