根据《阿飞正传》的剧情设定，阿飞生母不见他的原因可归纳为以下三点：

生母的贵族身份与尊严

阿飞的生母是菲律宾贵族，因维护家族尊严和地位，拒绝与私生子阿飞见面。这种身份背景导致她无法跨越阶级鸿沟与儿子建立联系。

养母的抚养动机与疏离

养母抚养阿飞仅为获取生母的抚养费，且因自身生活所迫，无法给予阿飞充分的关爱和安全感。这种功利性关系进一步加剧了阿飞对生母的疏离感。

阿飞自身心理与命运的悲剧性

阿飞因长期缺乏安全感，形成孤僻性格，对养母的怨恨转化为对生母的冷漠。最终在寻根失败后，因无法接受被遗弃的事实，在异国火车上被枪杀，象征着其精神世界的彻底崩塌。

综上，生母的拒绝是个人身份、家庭关系与阿飞心理状态共同作用的结果，最终成为其悲剧命运的重要推手。