军统特务张仲年的死亡方式可综合剧情信息整理如下：

核心事件

张仲年在得知余云禄是共党卧底后陷入疯狂，威逼其承认身份。余云禄反抗过程中开枪误中程菲致其身亡，张仲年因此陷入极度痛苦。随后，岳中盛驾驶载满炸药的吉普车闯入保密局，意图与张仲年同归于尽。

死亡细节

岳中盛引爆炸药后牺牲，但张仲年并未立即死亡。此时，刘啸尘在击毙杨玉林后窃得重要档案，被张仲年率人包围。在真相大白的关键时刻，张仲年意识到自己被刘啸尘长期迷惑，深感惭愧。

结局

张仲年最终被刘啸尘擒获，结束其军统生涯。剧情暗示他因长期被刘啸尘蒙蔽，未能识破其伪装，成为自我毁灭的参与者。

注：

以上信息基于电视剧《保密局》剧情描述，与现实中的历史人物无直接关联。