在《悲伤逆流成河》番外篇《黑暗源泉》中，钟源与秦佩佩的矛盾核心如下：

事件起因

钟源长期遭受秦佩佩的欺凌，包括被破坏学习用品（如课本丢失、自行车轮胎放气）、被故意扎伤等。她最终在一次报复中（如将图钉放入鞋内）被顾森西目击。

顾森西的误解

顾森西误以为钟源是幕后黑手，企图通过制造“坏人”形象获取同情。他发现钟源在黑板上写秦佩佩名字的行为后，进一步加深了这一判断。

真相揭露

番外结尾中，顾森西通过秦佩佩书桌内的照片、钟源被放气痕迹等证据，确认秦佩佩才是真正施暴者。钟源的反击行为被误读为自导自演。

角色对比与结局

- 钟源：

表面懦弱，实则善良，被秦佩佩长期压迫后爆发反抗，最终成为易遥悲剧的牺牲品。

- 秦佩佩：主动欺凌他人，利用顾森西的同情心制造假象，最终被揭露真面目。

总结：钟源是受害者，被秦佩佩蓄意陷害；顾森西因缺乏判断力，误将钟源视为坏人。真相大白后，两人均陷入更深的悲剧循环。